膜污染现象非常复杂，很难从理论上分析。甚至对一种给定溶液，其污染也是取决于浓度、温度、pH值、离子强度和具体的相互作用力（氢键、偶极一偶极作用力）等物理和化学参数。

膜的特性,如表面电荷、憎水性、粗糙度等对膜的有机吸附污染及阻塞有重大影响。例如，由极性的、亲水性的聚酰胺聚合材料制成的纳滤膜，其造成膜污染的有机物主要为如脂肪酸的两性有机物。它们都是阴离子表面活性剂，在聚酰胺膜面上的吸附可能由氢键作用、色散力吸附和憎水作用进行。这些表面活性剂吸附层的形成,使水分子要透过膜就必须消耗更高的能量，最终导致产水量的下降。

而非极性的、憎水性的有机物（如高碳烷燈）对膜的污染，是由于憎水性有机物与水间的相互作用使这些扩散慢的有机物富集在膜面上，即表现为憎水性的高分子低扩散性的有机物会浓缩在膜面上;而高分子有机物的浓差极化也有利于它们吸附在膜面上;此外，水中离子与有机物官能团相互作用，会改变这些有机物分子的憎水性和扩散性。