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在净水处理时，生物过滤法主要作为絮凝沉淀的预处理。此时需要除掉的物质除了悬浮物之外，还有氨性氮、铁、锰、异臭物质及硝酸性氮等。因此在净水处理时，生物过滤法所使用的场合多数是喜气式的，过滤介质宜用固定床形式。过滤方式既可以是向上流式，也可以是向下流式。 |
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对净水进行高度处理时，采用的方法大都为臭氧加活性炭。由于此法所用的活性炭上繁育有微生物，所以形成了生物活性炭。此法也是生物过滤法的一种。 |
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近来在探讨用生物过滤法除掉硝酸性氮，以减少其对地下水的污染。可是为了除掉硝酸性氮，必须添加甲醇等有机物，因此在净水处理时，要注意甲醇等的残留。 |
