广泛用于化工过程的分离与精制，废水净化处理并回收有用成分，工业废水零排放，活性污泥膜法废（污）水处理回用（膜生物反应器，MBR）等。在国外主要应用于饮用水处理，国内则主要用于工业领域的废水处理、回用，作为反渗透的前处理已被广泛认同，如微滤/反渗透组合的双膜法技术，在国内的工业水处理特别是电力、化工、汽车等行业中应用较多。
目前微滤膜的应用领域主要涉及工业水处理、食品医药领域内的分离、澄清、纯化、浓缩，机械制造业的电泳涂装，印染化工，环保等。